โออิตะ ทรินิตา, มาจิดะ เซลเวีย

ในเดือนกรกฎาคม พ.ศ. 2552 ปอปอวิชได้ตกลงเข้ารับตำแหน่งหัวหน้าผู้ฝึกสอนให้กับโออิตะทรินิตาในเจลีก ซึ่งแพ้มาแล้วติดต่อกัน 14 นัด โดยเขามาคุมทีมใน 6 นัดแรก ชนะได้เพียง 1 นัด แต่ใน 10 นัดสุดท้ายของฤดูกาล เขาสามารถทำทีมไม่แพ้ใครเลย (ชนะ 5 นัด และเสมอ 5 นัด) ทำให้เขาได้รับความไว้วางใจให้คุมทีมต่อในฤดูกาลถัดไป แต่สโมสรได้ล้มละลาย เขาจึงไม่ได้ทำทีมต่อ หลังจากนั้นจึงเซ็นสัญญากับมาจิดะ เซลเวีย ในวันที่ 15 ธันวาคม พ.ศ. 2553

ซาราโกซา

ในวันที่ 24 พฤศจิกายน พ.ศ. 2557 หลังจากการเป็นหัวหน้าผู้ฝึกสอนให้กับโตเกียว และ เซเรซโซ โอซะกะ เขาได้เซ็นสัญญากับซาราโกซา แทนที่บิกตอร์ มูญอซ[1]

ปอปอวิชได้ถูกไล่ออกในวันที่ 20 ธันวาคม พ.ศ. 2558 หลังจากแพ้กิมนัสติก 1–3[2]

บุรีรัมย์ ยูไนเต็ด

ในวันที่ 25 สิงหาคม พ.ศ. 2559 บุรีรัมย์ ยูไนเต็ด เซ็นสัญญาให้ปอปอวิชเป็นหัวหน้าผู้ฝึกสอน แทนที่ตำแหน่งที่ว่างหลังจากปลดอัฟชิน ก็อตบี ออกจากตำแหน่ง[3] ซึ่งเขาคุมทีมนัดแรกในวันที่ 10 กันยายน พ.ศ. 2559 ในเกมที่บุรีรัมย์ชนะ บางกอกกล๊าส 2–1 ในไทยลีก

ในช่วงกลางฤดูกาล 2560 ปอปอวิชลาออกจากตำแหน่งหัวหน้าผู้ฝึกสอน หลังจากที่ถูกแบนในการคุมทีมข้างสนาม 3 เดือน อันเนื่องจากเหตุการณ์ที่เขาไปทำร้ายร่างกายนักกายภาพของแบงค็อก ยูไนเต็ด ในนัดที่บุรีรัมย์เปิดบ้านเอาชนะแบงค็อก 2–1[4]